Só em 2024, mais de 500 novos genomas de plantas foram publicados. Em meio a esse ritmo vertiginoso, pesquisadores europeus lançaram o PubPlant, uma ferramenta gratuita, dinâmica e constantemente atualizada que permite aos pesquisadores explorar, analisar e compreender o mapa genético das plantas como nunca antes.

   No mundo da ciência vegetal, as últimas duas décadas foram uma verdadeira revolução. Desde a publicação do genoma de Arabidopsis thaliana, em 2000, mais de mil espécies de plantas foram sequenciadas, muitas delas graças a tecnologias impensáveis ​​há poucos anos. No entanto, esse avanço trouxe consigo um novo desafio: como organizar tanta informação, mantê-la atualizada e torná-la acessível a todos?

   A resposta veio este ano da Europa, onde um grupo de pesquisadores apresentou o PubPlant, um banco de dados online que visa se tornar o ponto de encontro de todas as informações genômicas de plantas publicadas até o momento. A plataforma não apenas reúne genomas já sequenciados, mas também os organiza, os contextualiza evolutivamente e os atualiza mensalmente.

   Publicado na revista Frontiers in Plant Science, o projeto foi liderado por Markus Schwacke, Thomas Usadel e outros cientistas especializados em bioinformática e genômica vegetal. O objetivo é simples, mas ambicioso: permitir que qualquer pessoa interessada (seja pesquisador, estudante ou profissional da agricultura) navegue pelo universo genético das plantas de forma intuitiva e confiável.

   O aspecto mais inovador do PubPlant é sua capacidade de se manter atualizado. Embora as revisões científicas tradicionais frequentemente se tornem obsoletas poucos meses após a publicação, esta ferramenta é atualizada mensalmente com as publicações mais recentes sobre sequenciamento do genoma completo de plantas.

   O estudo destaca que, após a publicação do genoma de Arabidopsis thaliana em 2000, levou uma década para atingir apenas 20 genomas sequenciados. No entanto, foram necessários apenas mais quatro anos para ultrapassar 100 e, em 2020, o marco de 500 espécies já havia sido alcançado. Desde então, o crescimento tem sido exponencial: nos dois anos seguintes, mais 500 genomas foram adicionados, uma conquista que antes levava vinte anos.

   Para ilustrar a magnitude do progresso, basta observar os dados mais recentes: somente em 2024, mais de 500 novos genomas foram publicados, dos quais 370 correspondiam a espécies sequenciadas pela primeira vez. Nesse ritmo, ter um banco de dados vivo e atualizado como o PubPlant não é apenas útil, mas também essencial para a pesquisa agrícola.

   Ao explorar o banco de dados, um dos primeiros padrões que se destaca é a forte preferência por espécies cultivadas. Famílias como gramíneas (trigo, arroz, milho), leguminosas (soja, feijão), solanáceas (batata, tomate) e brássicas (couve-flor, rabanete) estão amplamente representadas. E faz sentido: são as espécies que mais alimentam o planeta.

   Mas, ao mesmo tempo, o PubPlant destaca que muitas outras plantas (de árvores nativas a ervas medicinais) ainda aguardam sua vez de serem estudadas em profundidade. Essa ferramenta permite visualizar essas lacunas de conhecimento, o que pode orientar pesquisas futuras, especialmente em um contexto de crise climática e busca por novas fontes de alimentos.

   Um dos elementos-chave do projeto foi o foco na acessibilidade. O PubPlant foi projetado para que qualquer pessoa possa navegar sem conhecimento técnico avançado. Com apenas alguns cliques, você pode explorar linhas do tempo interativas, árvores evolutivas, mapas de distribuição taxonômica e links diretos para as publicações científicas originais.

   Cada entrada inclui informações detalhadas: nome científico, data de publicação, tamanho do genoma, método de sequenciamento e links para bancos de dados externos, como Ensembl Plants ou NCBI.

   Os autores do artigo enfatizam que o PubPlant é um recurso aberto, gratuito e comunitário. Seu sucesso dependerá da participação ativa da comunidade científica: compartilhando novas publicações, propondo melhorias e usando suas ferramentas para elaborar estratégias de pesquisa em plantas mais equilibradas e sustentáveis.

   Em um mundo onde a agricultura enfrenta desafios sem precedentes (secas, degradação do solo, novas pragas), compreender o genoma das plantas não é apenas uma curiosidade acadêmica, mas uma necessidade estratégica. O PubPlant está aqui para ser a bússola aberta nesta crescente selva de dados genômicos.

*Esta notícia foi publicada pela “ChileBio”, e pode ser acessada em seu idioma original através de: https://chilebio.cl/2025/07/03/el-google-maps-del-adn-vegetal-nace-pubplant-la-base-de-datos-que-organiza-y-explora-el-genoma-de-las-plantas/